В 1999 году закончила Санкт-Петербургскую государственную академию театрального искусства (класс н.а. России С. Спивака), в том же году была принята в труппу Театра-фестиваля «Балтийский дом».
В 2010 году окончила режиссерский факультет Московского театрального института им. Б.Щукина при Государственном Академическом театре им.Е.Вахтангова.
Режиссерские работы в Театре-фестивале «Балтийский дом»:
«Алиса в Стране чудес»,
«Приключения Мамы Му и её друзей»,
«Мадам Бовари»,
«Вестсайдская история»,
«Милый друг»,
«Королевство кривых зеркал»,
«Пиковая дама»
2024 год. Указом президента Российской Федерации Владимира Владимировича Путина актрисе Театра-фестиваля «Балтийский дом» Наталье Индейкиной присвоено звание «Заслуженный артист России» за вклад в развитие отечественной культуры и искусства, многолетнюю плодотворную деятельность.
2023 год. Спектакль «Великий Гэтсби» Новосибирского музыкального театра в постановке Натальи Индейкиной – номинант Российской Национальной театральной премии «Золотая Маска» в номинации «Лучший спектакль в оперетте/мюзикле».
2022 год. Лауреат Национальной премии «Музыкальное сердце театра» в номинации Лучшая пьеса (автор) за инсценировку романа «Великий Гэтсби» для Новосибирского музыкального театра.
2009 год. Высшая театральная премия Санкт-Петербурга «Золотой софит». Победитель в номинации «Лучшая роль второго плана» за роль Кассирши в спектакле «Лерка» в постановке А. Прикотенко. Театр-фестиваль «Балтийский дом»
2008 год. XVII фестиваль «Театр Санкт-Петербурга – детям». Победитель в номинации «лучший дебют» за постановку спектакля «Приключения Мамы Му и её друзей» по сказке Дж. Висландер.
2006 год. За участие в фильме «Последний день актрисы Марыськиной» награждена (совместно с режиссером П.Амелиным) Дипломом XIV открытого ежегодного российского конкурса студенческих и дебютных фильмов «Святая Анна» – «За совместное освоение жанра комедии».
2005 год. Дипломант VII Международного фестиваля актерской песни имени Андрея Миронова, приз нижегородского отделения СТД РФ
Короли и волшебники (2000), Агентство НЛС (2001), Первое мая (2001), Убойная сила-2 (2001), Черный ворон (2001-2004), Крот-2 (2002), Тайны следствия-2 (2002), Улицы разбитых фонарей-4 (2002), Ментовские войны-3 (2006), Опера-2. Хроники убойного отдела (2006), Последний день актрисы Марыськиной (2006), Дюжина правосудия (2007), Возвращение Синдбада (2009), Врач (2010), Дорожный патруль-4 (2010), Литейный (2011), Часы любви (2011), Хвост (2012), Двое с пистолетами (2012), Внутреннее расследование (2014), Иные (2014), Чужой (2014), Женщина в беде-4 (2016), Такая работа (2016), Акватория (2017), Гражданский брак (2017), Обратный отсчёт (2017), Скоро всё кончится (2017), Арена для убийства (2018).